Pachacamac fue una vez parte del Imperio Huari de c.AD 200-600, y en el período temprano contenía al menos una pirámide, un cementerio y un fresco policromado de peces. Los Huari apoyaron la construcción en Pachacamac, convirtiéndolo en un importante centro administrativo Huari.
Después del colapso de Huari, Pachacamac creció en tamaño, cubriendo finalmente alrededor de 85 hectáreas. Durante esta fase tardía (c.800-1450), se construyeron la mayoría de sus compuestos arquitectónicos y 17 pirámides. La unidad arquitectónica principal es el recinto amurallado que contiene una pirámide escalonada, estructuras de almacenamiento y patios. El sitio está organizado alrededor de dos avenidas perpendiculares, alineadas con las direcciones cardinales, que se cruzan entre sí en el centro del sitio.
Después de la expansión del imperio inca, Pachacamac se convirtió en un importante centro administrativo inca, manteniendo su estatus como santuario religioso. El Inca construyó cinco complejos separados allí, incluyendo la Pirámide del Sol y la Mamacuna. Este último contiene fina mampostería inca en su puerta de entrada, una rareza en la costa. El conquistador español Francisco Pizarro oyó hablar de Pachacamac mientras mantenía prisionero al rey inca Atahualpa en Cajamarca en 1532. Rápidamente envió una expedición para saquear el centro. Los conquistadores españoles se apoderaron de una gran cantidad de plata y oro del sitio y destruyeron un ídolo importante. Los relatos españoles indican que Pachacamac era uno de los santuarios más sagrados de los Andes centrales. El nombre del sitio deriva del término quechua para la deidad costera, Pacha Camac [El que vitaliza el Universo]. El templo principal en el sitio estaba dedicado a esta deidad de dos caras y tenía un famoso oráculo. Los peregrinos viajaban al centro desde grandes distancias, y su cementerio era considerado sacrosanto.
El sitio de Pachacamac se ha conservado, y una de las estructuras incas, la Mamacuna, ha sido reconstruida.
